Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms