Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms