Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms