Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KHDC1Q4VXA5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms