Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C1Q4G0N8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC9C1Q4G0N8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9C1Q4G0N8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms