Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms