Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LSM12Q3MHD2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms