Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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