Protein–RNA interactions for Protein: Q16890

TPD52L1, Tumor protein D53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L1Q16890 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPD52L1Q16890 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52L1Q16890 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms