Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGISQ16647 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGISQ16647 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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