Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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