Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FXNQ16595 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FXNQ16595 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FXNQ16595 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FXNQ16595 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FXNQ16595 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FXNQ16595 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FXNQ16595 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FXNQ16595 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FXNQ16595 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FXNQ16595 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FXNQ16595 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FXNQ16595 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FXNQ16595 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FXNQ16595 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FXNQ16595 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FXNQ16595 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FXNQ16595 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FXNQ16595 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FXNQ16595 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms