Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK5Q16478 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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