Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1AQ15573 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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