Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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