Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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SEC23BQ15437 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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SEC23BQ15437 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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SEC23BQ15437 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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SEC23BQ15437 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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SEC23BQ15437 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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SEC23BQ15437 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEC23BQ15437 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SEC23BQ15437 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC23BQ15437 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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SEC23BQ15437 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SEC23BQ15437 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC23BQ15437 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC23BQ15437 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC23BQ15437 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC23BQ15437 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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