Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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