Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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