Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KARSQ15046 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KARSQ15046 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KARSQ15046 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KARSQ15046 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KARSQ15046 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KARSQ15046 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KARSQ15046 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KARSQ15046 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KARSQ15046 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KARSQ15046 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KARSQ15046 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KARSQ15046 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KARSQ15046 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KARSQ15046 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KARSQ15046 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KARSQ15046 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KARSQ15046 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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