Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD1Q15011 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms