Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLCA4Q14CN2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA4Q14CN2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms