Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GAPVD1Q14C86 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
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