Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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