Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD9Q14511 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms