Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX2Q13950 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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