Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB1Q13884 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms