Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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DDX39BQ13838 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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DDX39BQ13838 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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DDX39BQ13838 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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DDX39BQ13838 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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DDX39BQ13838 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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DDX39BQ13838 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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DDX39BQ13838 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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