Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOFQ13790 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOFQ13790 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOFQ13790 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOFQ13790 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
APOFQ13790 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOFQ13790 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOFQ13790 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOFQ13790 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOFQ13790 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOFQ13790 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOFQ13790 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOFQ13790 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOFQ13790 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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