Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1A4Q13733 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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