Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P11Q13670 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms