Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDE3BQ13370 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
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