Protein–RNA interactions for Protein: Q13118

KLF10, Krueppel-like factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF10Q13118 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF10Q13118 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF10Q13118 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms