Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CNTN1Q12860 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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