Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YHL049CYHL049C 816 nt4.36□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 LOH1YJL038C 660 nt4.36□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YKL162CYKL162C 1209 nt4.36□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt4.36□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 ARL3YPL051W 597 nt4.36□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 CCL1YPR025C 1182 nt4.36□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SEG2YKL105C 3399 nt4.36□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 MIH1YMR036C 1665 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YKR015CYKR015C 1707 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SPO1YNL012W 1896 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 PMS1YNL082W 2622 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 VAC17YCL063W 1272 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 PEF1YGR058W 1008 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YJL028WYJL028W 336 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 VPS25YJR102C 609 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YLR407WYLR407W 687 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YIM1YMR152W 1098 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 WRS1YOL097C 1299 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 HUA2YOR284W 732 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 PBP2YBR233W 1242 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 COM2YER130C 1332 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SOF1YLL011W 1470 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SFI1YLL003W 2841 nt4.35□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SSA2YLL024C 1920 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 PER1YCR044C 1074 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SPR28YDR218C 1272 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YJL032WYJL032W 315 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 MRPS17YMR188C 714 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YBL059WYBL059W 582 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 MRM1YOR201C 1239 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 UAF30YOR295W 687 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YPL114WYPL114W 420 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 DIM1YPL266W 957 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 RKM3YBR030W 1659 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 FAA3YIL009W 2085 nt4.34□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 PAH1YMR165C 2589 nt4.34□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 POL12YBL035C 2118 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 MSC7YHR039C 1935 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RFT1YBL020W 1725 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 MSK1YNL073W 1731 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 THI20YOL055C 1656 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 ATP16YDL004W 483 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 snR7-SsnR7-S 179 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YDL228CYDL228C 642 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 HSP42YDR171W 1128 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 CWC23YGL128C 852 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YHL044WYHL044W 708 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RPS4BYHR203C 786 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YUH1YJR099W 711 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RPS4AYJR145C 786 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YLR339CYLR339C 552 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YMR315WYMR315W 1050 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 POP3YNL282W 588 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 SAS5YOR213C 747 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 ATP20YPR020W 348 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RAD16YBR114W 2373 nt4.33□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 SPS2YDR522C 1509 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 MEF2YJL102W 2460 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YLR108CYLR108C 1458 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 HOT1YMR172W 2160 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 GPM2YDL021W 936 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 ARC1YGL105W 1131 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 BTN2YGR142W 1233 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 GPP1YIL053W 753 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 TVP38YKR088C 1014 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YAP7YOL028C 738 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 ATG5YPL149W 885 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 MAL12YGR292W 1755 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 MAL32YBR299W 1755 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 FLC1YPL221W 2382 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 CYM1YDR430C 2970 nt4.32□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 KIN2YLR096W 3444 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 NAM9YNL137C 1461 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YCL076WYCL076W 744 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RPL22BYFL034C-A 369 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 PRP18YGR006W 756 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RSM27YGR215W 333 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 EFB1YAL003W 621 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YJL218WYJL218W 591 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YLR271WYLR271W 825 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 SRT1YMR101C 1032 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YMR130WYMR130W 909 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YOR131CYOR131C 657 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 FDH1YOR388C 1131 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 OXR1YPL196W 822 nt4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms