Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGEF1BQ0VAM2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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