Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms