Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP300Q09472 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP300Q09472 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EP300Q09472 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP300Q09472 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP300Q09472 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP300Q09472 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP300Q09472 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP300Q09472 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP300Q09472 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EP300Q09472 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
EP300Q09472 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EP300Q09472 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP300Q09472 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP300Q09472 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EP300Q09472 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms