Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms