Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms