Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F3Q08477 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms