Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms