Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SOS1Q07889 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms