Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms