Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEUP1Q05D60 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms