Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN1Q05586 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms