Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms