Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGFBR3Q03167 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms