Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN2Q02246 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms