Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms