Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDLBPQ00341 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms